La caratterizzazione del virus dell’HIV in coppie di trasmissione può aiutare a identificare le determinanti biologiche della contagiosità e a valutare i possibili interventi per ridurre la trasmissione. Sebbene la sequenza dell’HIV sia frequentemente utilizzata per convalidare la relazione tra i nuovi individui positivi al virus e i loro partner sessuali in studi forensi ed epidemiologici, essa viene raramente applicata a esperimenti di prevenzione dell’HIV.
Un corposo team di ricercatori della Scuola di medicina di Seattle ha analizzato 3408 coppie eterosessuali e siero discordanti per l’HIV (in cui dunque un solo partner è positivo al virus), selezionate in 14 regioni di 7 paesi dell’Africa Sub-Sahariana, per determinare l’efficacia della soppressione dell’herpes genitale nella riduzione della trasmissione dell’HIV, come parte dell’analisi di studio, le sequenze dell’HIV sono state esaminate per la relazione genetica tra i siero convertiti e i loro partner. Dall’analisi dei dati raccolti, è emerso che oltre un quarto (il 26,5%) delle trasmissioni dell’HIV tra partner non era legato al partner coinvolto nello studio. I maschi siero convertiti avevano una più alta frequenza di trasmissione a partner diverse rispetto alle donne siero convertite. Infine, è stata riscontrata una carica virale basale significativamente più elevata tra i soggetti contagiatori legati tra loro.
Questo approccio di studio e i suoi risultati sono rilevanti sia per il futuro dei programmi di prevenzione dell’HIV che hanno come target partner infetti e sia per  gli studi che indagano le caratteristiche virologiche, immunologiche e genetiche determinanti per la trasmissione dell’HIV.

M.S. Campbell, J.I. Mullins, J.P. Hughes, C. Celum, K.G. Wong, D.N. Raugi et al., Viral Linkage in HIV-1 Seroconverters and Their Partners in an HIV-1 Prevention Clinical Trial, Plos One, March 2011 – vol. 6 – issue 3